ANTIBIORÉSISTANCE
Dissémination de la résistance
La dissémination de l’antibiorésistance dans l’environnement est surtout le fait des matières fécales et des eaux usées. Le microbiote digestif est un réservoir important de gènes de résistance aux antibiotiques. La forte concentration en bactéries (environ 1011/g de selles) favorise les échanges de gènes et la dissémination des gènes de résistance. En effet, certaines régions du monde (essentiellement l’Asie du Sud-Est et certains pays d’Afrique) présentent une haute prévalence de bactéries multirésistantes, voire ultrarésistantes, du fait de l’utilisation, souvent incontrôlée, des antibiotiques à large spectre. Tous les pays en zone intertropicale présentent un portage communautaire élevé d’entérobactérales productrices de BLSE telles qu’Escherichia coli ou Klebsiella pneumoniae, voire parfois un portage hospitalier élevé de carbapénémases. La transmission de ces bactéries peut s’effectuer lors de soins médicaux prodigués dans les hôpitaux de ces régions ou lors des flux de populations (immigration, tourisme de masse…). Cela a par exemple été le cas des premiers isolats de bactéries productrices de carbapénémases détectés en Europe, issus du bassin méditerranéen ou du sous-continent indien. De plus, l’utilisation fréquente d’antibiotiques lors de la survenue d’infections gastro-intestinales bactériennes (salmonelloses, shigelloses…) dans ces régions d’endémicité conduit à la sélection et la prolifération des bactéries résistantes au niveau du tractus digestif.
Par ailleurs, l’environnement anthropisé est une source de dissémination de la résistance aux antibiotiques. Les eaux usées sont particulièrement riches en bactéries résistantes et donc en gènes de résistance. L’élimination fécale des antibiotiques contribue à favoriser la sélection et la dissémination de ces bactéries. Il est par ailleurs estimé que 30 à 90 % des antibiotiques ingérés sont naturellement excrétés, ce qui constitue une pression de sélection antibiotique considérable dans l’environnement. Les concentrations subinhibitrices d’antibiotiques retrouvés dans les effluents permettent de créer un environnement propice à la dissémination et à l’acquisition de la résistance par de nombreux types bactériens. Il est, de ce fait, possible de corréler la pollution fécale humaine et animale à la dissémination de la résistance par les effluents. Ainsi, plus de 60 % des gènes de résistance retrouvés dans les effluents sont portés par des éléments génétiques mobiles et donc capables de dissémination entre bactéries. Cela est directement corrélé au type d’antibiotique utilisé et au niveau de leur consommation dans les structures d’où proviennent les effluents. La convergence des effluents urbains, hospitaliers et agricoles (environnement anthropisé) dans les rivières (environnement naturel) favorise le contact entre les bactéries de ces différents milieux et peut permettre l’émergence de nouveaux isolats différemment résistants, par brassage des éléments génétiques mobiles et des gènes de résistance.
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Écrit par
- Aurélie CHABAUD : pharmacienne-biologiste spécialisée, laboratoire de bactériologie virologie hygiène, CHU de Limoges
- Sylvain MEYER : assistant hospitalo-universitaire, laboratoire de bactériologie virologie hygiène, CHU de Limoges
- Marie-Cécile PLOY : professeure des Universités, praticienne hospitalière, laboratoire de bactériologie virologie hygiène, CHU de Limoges
Classification
Médias
Répertoire des résistances bactériennes aux antibiotiques
Encyclopædia Universalis France
Principaux mécanismes de résistance
Encyclopædia Universalis France
Progression de la résistance aux antibiotiques
Encyclopædia Universalis France
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