GÉNOMIQUE : ANNOTATION DES GÉNOMES
Bibliographie
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Sites Internet
FASTQC : https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/Help/
GATK (Genome Analysis ToolKit) : https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us
Projet POPGEN, Diversité génomique de la population française : https://lysine.univ-brest.fr/popgen/
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Écrit par
- Véronique BLANQUET : professeure de génétique, université de Limoges
- Stéphanie DURAND : maître de conférences, faculté des sciences et techniques de Limoges
Classification
Médias
Étapes de l’analyse bio-informatique des séquences d’ADN
Encyclopædia Universalis France
Principe de l’approche dite Greedy pour l’assemblage de novo de fragments d’ADN
Encyclopædia Universalis France
Principe de l’approche OLC (Overlap Layout Consensus) pour l’assemblage de novo des produits de séquençage
Encyclopædia Universalis France
Autres références
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SÉQUENÇAGE DU GÉNOME HUMAIN, en bref
- Écrit par Nicolas CHEVASSUS-au-LOUIS et Encyclopædia Universalis
- 286 mots
Le 12 février 2001, les revues scientifiques Nature et Science publient la séquence quasi complète des trois milliards de bases du génome humain. Cette double publication conclut par un ex aequo la compétition entre un consortium international de laboratoires publics, qui a commencé ses...
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Des gènes responsables de la résistance aux herbicides, aux infections virales, fongiques ou bactériennes, identifiés grâce au progrès de lagénomique, sont utilisés pour transférer aux plantes ces mêmes propriétés de résistance. C'est en 1985 que les premiers essais en champ de plantes transgéniques... -
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...scientifique s'est accélérée, engendrant des bouleversements imprévisibles de notre compréhension du monde, y compris celui des plantes. La génomique, par exemple, est en train de révéler une évolution et un fonctionnement bien plus complexe des génomes d'eucaryotes (organismes pourvus d'un... -
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