BIO-INFORMATIQUE

Articles

• BIOTECHNOLOGIES

  • Écrit par Pierre TAMBOURIN
  • 5 368 mots
  • 4 médias
  ...développement de la génomique (transcriptome, protéome, métabolome) et capables d'appréhender désormais le vivant à un niveau de complexité qui impose une bio-informatique solide susceptible de stocker les innombrables données obtenues mais aussi d'aider à leur interprétation en permettant de conceptualiser...

• BOTANIQUE

  • Écrit par Sophie NADOT et Hervé SAUQUET
  • 5 647 mots
  • 7 médias
  ...généralement au laboratoire par le botaniste lui-même, bien que la phase de lecture tende de plus en plus à être traitée par de grands centres de séquençage. Une fois les séquences obtenues, le reste du travail s'effectue sur ordinateur : tout d'abord l'alignement (mise en correspondance des séquences de différentes...

• CARTOGRAPHIE CELLULAIRE DU CERVEAU

  • Écrit par Jean-Gaël BARBARA
  • 2 990 mots
  • 2 médias

  Pendant longtemps, la résolution des cartes anatomiques du cerveau dont disposaient les neurobiologistes pour placer les indices des diverses activités cérébrales n’excédait pas l’échelle des petits réseaux de neurones et des liens existant entre eux.

  Si de très nombreuses données cellulaires...

• CLADISTIQUE

  • Écrit par Pascal TASSY
  • 3 007 mots
  • 4 médias
  La cladistique a vite utilisé l'informatique. En effet, analyser de façon simultanée une multitude de caractères pour de nombreuses espèces, afin de construire l'arbre phylogénétique, est au-delà des capacités de l'esprit humain. Il est parfois difficile de faire ressortir la solution qui rend compte...

• CLASSIFICATION DU VIVANT

  • Écrit par Pascal DURIS et Pascal TASSY
  • 7 202 mots
  • 6 médias
  D' Amérique vinrent, à la fin des années 1960, les premiers algorithmes dits de parcimonie. Les ordinateurs calculent ce que ne peut faire le cerveau humain : la congruence maximale des distributions de caractères chez les espèces étudiées. Les parentés sont exprimées sous la forme d'un arbre –  le...

• ÉPIDÉMIES ET PANDÉMIES

  • Écrit par Jacqueline BROSSOLLET , Georges DUBY , Encyclopædia Universalis , Gabriel GACHELIN et Jean-Louis MIÈGE
  • 20 849 mots
  • 15 médias
  ...années qui ont suivi le début de la pandémie du sida. L’explosion d’informations qui en résulte bénéficie par ailleurs du développement de l’informatique, des programmes bio-informatiques et du traitement d’ensembles très volumineux de données. Celles acquises sur le terrain hospitalier et au laboratoire...

• EXPOSOME

  • Écrit par Élodie GIROUX
  • 4 797 mots
  • 2 médias
  ...particulier dans le champ de la médecine de précision. Une évaluation multiexposition au niveau bien plus vaste requis par l’exposome exige le développement d’outils bio-informatiques pour l’analyse et le traitement de données massives et le suivi sur le long terme de grandes cohortes d’individus.

• GÉNIE GÉNÉTIQUE

  • Écrit par Louis-Marie HOUDEBINE
  • 3 338 mots
  • 6 médias
  ...celles-ci (identification et détermination de la structure des gènes, modification des messages génétiques et introduction dans des organismes vivants) est de plus en plus confiée à des robots. La somme des informations qui en découle devient chaque jour plus écrasante. Les biologistes travaillent désormais...

• GÉNOME HUMAIN

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
  • 3 903 mots
  • 1 média
  ...produits d'expression (transcriptomes et protéomes) d'un grand nombre de types cellulaires différents, puis a recherché leur présence dans le génome humain, l'ensemble de ces informations étant traité dans deslaboratoires de bio-informatique qui s'appuient sur des applications construites à cette fin.

• PHYLOGÉNOMIQUE

  • Écrit par Gabriel GACHELIN
  • 3 017 mots
  ...technologiques, tant en ce qui concerne les machines qui permettent la détermination automatique et rapide des séquences d'ADN à des coûts devenus très bas, que pour ce qui est des algorithmes et des logiciels de la bio-informatique. Avec le développement de ces derniers, il est possible d'extraire de la séquence...