Dégradation du carbone organique des sols
Les micro-organismes du sol sécrètent dans l'eau du sol des enzymes qui, au moins pour une partie d'entre elles, engendrent la solubilisation des molécules carbonées organiques provenant essentiellement de la matière végétale. Ces molécules solubilisées peuvent alors être absorbées par les micro-organismes du sol, notamment les bactéries. Elles sont alors soit modifiées au cours de l'anabolisme pour assurer l'entretien et la multiplication de ces micro-organismes, soit dégradées afin de fournir l'énergie nécessaire aux bactéries. La dégradation ultime des molécules organiques s'accompagne de la libération dans l'environnement de dioxyde de carbone, de nutriments minéraux, comme l'azote, et de déchets organiques divers. Certains de ces éléments produits (carbone minéral, nutriments minéraux...) sont alors assimilables par les plantes (d'après E. D. Schulze & H. A. Mooney, Biodiversity and Ecosystem Function, Springer, 1993).
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